بوجد شك فى أن عدوى ميكروبية قد يكون السبب الأساسى فى المرض أو فى احداث الخلل المناعى المسبب له وذلك لتشابه انسجة المرض لبعض انسجة امراض الدرن وان ميكروب شبيه  بمكروب الدرن تم عزله من الأمعاء المصابة بغد استئصالها فى العمليات الجراحيةفى بعض وليس كل الحالات

ميكروبات أخرى مثل البكتربا الحلزونية والسودومونس

مرض كرونز يصيب المدخنين بنسبة أكبر من غير المدخنين

كما ان التدخين عامل هام جدا فى تفاقم المرض وإعادة ظهوره

بالرغم من ذلك مازلنا لا نعرف ما هو العنصرالذى يؤدى إلى ذلك فى داخل السيجارة من عشرات السموم المعروفة بداخلها